Conocemos la existencia del mercado de Sant Josep desde el año 1217 en el que el rey concedió a un particular la propiedad de un mostrador. Pero en un principio se encontraba un poco más abajo de Ramblas.
La primera piedra de su ubicación actual se puso en 1840 bajo la cual se pusieron varias monedas de oro.
En 1914 la Maquinista Terrestres construyo el techo metálico
A este nuevo mercado se fueron sumando nuevos comercios como paja, frutas y verduras ya que en su origen era un mercado de carne.
El nombre actual se debe a que el barrio Judio del Call (cercano) hacía un mercado ambulante en la explanada cercana al mercado. En este mercado se vendía chivo (boc en catalán) y de ahí boquería.
A pesar de haber recibido diferentes nombres durante su larga historia, el nombre de Boquería a quedado en la memoria de todos los barceloneses y pocos saben que su nombre es en realidad Sant Josep